Skattestyrelsen kan kun gennemføre ekstraordinær genoptagelse efter skatteforvaltningsloven § 27, hvis reaktionsfristen i § 27, stk. 2 overholdes. Fristen kræver, at varsling sker senest seks måneder efter, at myndigheden har fået kundskab om de forhold, som begrunder fravigelsen af den ordinære varslingsfrist i § 26. Overskrides fristen, bortfalder forhøjelsen som udgangspunkt.
Praksis viser, at dette gælder også i sager, der ikke offentliggøres. En nyere ikke-offentliggjort afgørelse fastslår, at Skattestyrelsen ikke kan udskyde fristens begyndelsestidspunkt ved at vælge, hvornår sagen påbegyndes, eller ved at koordinere med andre myndigheder. Kundskabstidspunktet knytter sig til, hvornår Skattestyrelsen faktisk er eller burde være bekendt med de relevante forhold, ikke til interne arbejdsgange.
For skatteydere betyder det, at kontrolsager bør undersøges for rettidig varsling og klar hjemmel. Manglende iagttagelse af reaktionsfristen kan føre til, at en forhøjelse annulleres, uanset sagens materielle indhold. Ikke-offentliggjort administrativ praksis kan påberåbes til støtte i øvrige sager, og domstolsprøvelse kan komme på tale, hvor der er tvivl om fristens udgangspunkt eller myndighedens sagsoplysning.
